KUBTEC种子育种筛选分析功能

KUBTEC种子育种筛选分析功能

食品安全是未来几十年的一大挑战。随着人口的迅速增长，对食物的需求也在增加。为了解决这个问题，需要在植物育种方面取得进展，以改善植物品种。植物育种被称为操纵植物物种，以改变植物的特征，以创造具有理想特性的新种子。利用先进的技术可以很容易地收集植物物种的基因型，但表型分析仍处于起步阶段。基因型是细胞的遗传结构，表现型是指生物体的物理特征或特性。表型[2]是生物体基因序列、基因型和环境影响的基因表达的结果。基本上，不同的表型可以存在于同一种物种中。在过去的10年里，基因组数据已经大大增加，而确定相应表型的方法却很少。虽然基因组数据广泛可用，但有助于研究基因组功能以选择育种计划的相应表型仍然是被动的，特别是从育种计划的田间试验中收集的表型[1]。在收集相应表型的模型方面几乎没有任何进展。这导致了连接基因型和表型的数据集的不平衡。在植物育种计划中，对表型测定领域的进步的需求一直在升级。因此寻求融合当代图像处理和机器视觉的进展，有效收集精确的表型数据，以破译植物基因组和推进植物育种[1]。该研究是美国国家科学基金会(NSF)农业发展基础研究(BREAD)项目BreadPheno的一部分。

X射线成像在农业种子和林业筛选中有多种应用。以下是一些常见的应用领域：

种子质量评估：X射线成像可以用于评估种子的质量，包括检测种子的内部结构、内部缺陷和病虫害感染情况。通过观察种子的内部图像，可以判断种子的健康状况和萌发潜力。

种子萌发测试：通过使用X射线成像技术，可以观察种子在不破坏外壳的情况下的萌发过程。这有助于评估种子的萌发率和萌发速度，并为农民或种子生产商提供种子质量的重要信息。

林木品质评估：在林业中，X射线成像可用于评估树木的品质和内部结构。通过扫描树干、根部和树木切片，可以检测木材的缺陷、质量和稳定性，以支持木材选择、加工和用途。

病虫害检测：X射线成像还可以用于检测和诊断农作物和林木中的病虫害。通过扫描受感染植物部分的X射线图像，可以观察和分析病虫害的影响范围和严重程度。

种子软件分析软件功能-KUBTEC种子分析功能

原始图片

1. 可以自动识别种子，勾画轮廓，判断种子发育状态，多种参数：包括种子ID，种子周长Perimeter，种子轮廓C,种子半长轴L,种子半短轴S，种子面积A，种子密度D等多种参数，可以选择任意两参数作为分析的关键因素作图分析

此处根据种子的半长轴L及半短轴D作散点图，可以认为周长在100左右，短半轴S在（15:18）长半轴L在（38:40）左右时，面积A在（400-550）时，红色点处种子处于初始状态，未见发芽

【图片来自博卓生物】

2. 可以一键生成散点图，单击定位种子状态，散点图与原始图片结合

图片中绿色点短半轴S在（20：23）显示种子开始膨胀，但此时出芽不够明显长半轴L在(33:40)区间，显示刚刚萌芽状态

【图片来自博卓生物】

3. 可以预览散点图上每个种子的形态状况

4. 可以对种子形态进行无限分群分类分析，并保存分类结果与图片，由此判断种子发育发展阶段

5. 可以对种子进行色彩分析育种状态

6. 可以对种子进行计数分析